后来他的四个儿子都娶了蒙古女子为妻。尤其是皇太极，为了对付明朝，积极推进满蒙联姻。在建立大清国后，皇太极册封的五宫后妃都来自蒙古博尔济吉特氏家族，其中三位漂亮的后妃辈分是姑侄。

顺治皇帝也是近亲结婚，他娶了孝庄太后的两个侄女和一个侄孙女，也就是说，顺治不仅娶了两个亲表妹，还娶了自己的表侄女为妻。

不仅如此，金国大汗、大清国皇帝、王、贝勒等贵族不单娶了蒙古族部落的女子为妻，他们还把自己的女儿嫁过去，这些混乱的婚姻关系，让皇室家族的血脉变得及其混乱。

至清朝政权入关以后，康熙皇帝也曾娶过自己的表妹，而且他的后妃中有四对亲姐妹。这种近亲婚配说到底还是为了维持皇族利益，政治婚姻为历朝清帝奉行的基本国策，可以说从孝庄太后到隆裕皇后，近亲婚配的陋习一直贯穿于整个清朝历史。

然而这种近亲的婚配给后来的三代帝王带来了灭顶灾难，从同治到光绪再到宣统，整整50年的时间，皇宫之中再也没有生下一男半女。

同治帝于同治十一年(1872年10月)举行大婚典礼，死于同治十三年十二月(1875年)，这期间两年多时间，他居然没有留下一点骨血，何况同治皇帝较为好色。

光绪皇帝死的时候三十八岁，虽然在政治上难有作为，但是在婚姻上他还是有很大的自由度的，慈禧不会干涉他的私生活。而且作为一国之君，他起码也有着皇后妃子，几名女子陪伴，他最宠爱的珍妃常伴身边，但膝下无子，确实让人费解。

而作为末代皇帝溥仪，他活了六十一岁，但也没有留下后代。晚清接连三代皇帝都没有留下子嗣，的确让人震惊。在在中国封建历史上是绝无仅有的事，“不孝有三，无后为大”，普通百姓尚且如此，一个皇帝没有生育能力是会被天下人耻笑的。

其实了解清史的朋友会发现，清朝帝王的儿子夭折率也是出奇的高，除了康熙皇帝的皇子存活高点以外，自他以下的皇帝所生皇子大多夭折，咸丰作为清朝最好色的皇帝，在位十一年，一生也只生育了两个皇子，其中一个也夭折了。

三朝皇帝个个绝后，是爱新觉罗的先祖们种下的恶果，他们近亲婚配和乱伦的行为使得血脉是纯之又纯了，却导致了后来大清帝王身体的病变，更是三朝帝王不孕的直接原因。