九九峰据说总共有99个山峰,因而得名。从远处眺望,这些分布密集而不规则的小山峰,很像跳跃的火焰,因此又称为火炎山,且山明水秀,风光旖丽,为南投县境内着名的观光景点,山脚下设有露营区及文建会规划的国家艺术村。
九九峰之地质属更新世头嵙山层上部的火炎山砾石层,厚度约1000公尺,地形呈现锯齿状的山峰,由于砾石层的透水性良好,乾燥时胶结紧密坚硬,雨季则易受雨水侵蚀下切,造成许多尖锐的山峰与深沟。另位于乌溪溪畔部分,常因受溪水淘空坡脚而造成崩塌,形成悬崖峭壁的雄壮景观,深具观赏、科学研究及环境教育解说之价值,是台湾地区除三义火炎山、六龟十八罗汉山之外,着名的三大火炎山地形之一。尤其是在921大地震后,各山头之砾石崩落,形成光秃秃的独特景观,实有尽速妥善规划保护之必要。所以在89年5月,引用文化资产保存法之规定,划设为九九峰自然保留区。
九九峰位于乌溪北岸,主要的范围在埔里事业区第8到20林班范围内,行政区分属南投县草屯镇、国姓乡及台中市雾峰区、太平区境内,从台14甲线公路双冬路段上可清楚看见许多并列的山峰,即是九九峰所在的位置。
在本区以南多为平原区,北边则为苗栗丘陵区,西南季风向北吹袭至本区时,受地形之影响突然被举昇,导致本区多雾且湿度大。气温上最高平均温为7月的34.5℃,最低平均温为2月的12.1℃。相对湿度约为86%。平均降水量约为1800公厘。火炎山在地质上属第四纪的台地堆积,是剧烈造山运动的产物,本区岩层主要由厚层砾石组成,间夹薄层砂岩,地形脆弱,由于风化、侵蚀作用不断,地形切割得支离破碎,由于雨水的冲蚀,切割面往往又极为平整,因之在外形上形成尖锐山峰的组合及深谷里满布卵石的景象,如由南向北观之则更能显现其雄伟壮丽的景观。在南向的山谷内堆满了卵石,平时无水,望似卵石河流。
本区内蕴育丰富的松林植群,岭线上松树虽随着砾石而不断地崩落,但在峭壁上,松树又多属天然下种,演替为纯林。松树崩落与再生的动态演替过程,尤具特色。除松树群落之外,尚有相思树、枫香、大头茶、杜鹃等阔叶树林与多种蕨类植物,此亦具区域代表性,殊为可贵,值得保护。大部份植物均属演替先期之阳性植物,当地最大的松树胸径为60公分左右,为旧日原有松林经过火灾之后倖存者。一般而言,松林为强阳性之先驱植物,难成全然郁闭的森林。
921震灾后秃顶的九九峰划为自然保留区,农委会林务局与特有生物研究保育中心最近完成区内野生动植物资源调查,发现无论是动植物经自然复育族群种类及分布,都已接近震灾前的水准,最难得的是连濒临绝种的特有种台湾长鬃山羊和蓝腹鹇也现踪九九峰。植物方面本区发现之稀有植物台湾特有种-台湾梭椤木(ReevesiaformosanaSprague)。零星分布在九九峰部分山沟间,于自然保留区族群数量很小,加上果实中种子多为不孕性,其所面临的危机值得重视。随后更发现稀有植物金缕梅科-秀柱花,以林务局自然资源与生态资料库-台湾的稀有及濒危植物列表中,秀柱花保育等级为易受害(VU),族群数量减少速率,预估10年或三世代内超过20%。另特有生物保育研究中心(2000)调查九九峰地区921大地震后对地方造成的丕变发现原先少数分布山头植物如降真香等,可能已在当地消失。
虽然921地震严重改变了此地的地形地貌,造成一片穷山恶水的景象,不过经过农委会特有生物研究保育中心的调查,还是记录了7目12科18种哺乳类动物,其中最令人意外的,是在这种低海拔且人为活动频繁的地方,竟然发现了原应在人烟稀少,中高海拔山区活动的台湾山羊,以及2000年才发表的台湾特有新种蝙蝠黄颈蝠。
植被的组成其树冠层常以血桐、刺竹、山黄麻、白匏子、龙眼、荔枝等植种为主,台湾铁苋、虫屎、相思树、糙叶榕、无患子也颇为常见,灌木层则以龙眼、山柑、小梗黄肉楠、龙船花、九节木、土肉桂等为主;猿尾藤、老荆藤、菊花木、葛藤、血藤、七日晕等则为常见的爬藤。地震后大量快速生长的木本植物以山黄麻、白匏子、、血桐、山盐青等阳性树种为主,而小花蔓泽兰、毛西蕃莲、台湾芦竹、臭茉莉、大黍、五节芒、杜虹花等则攀爬于地表或丛生于地面。
目前九九峰山顶上的造林成果并不理想,而不断有土石松落的山腰,以及崩塌严重的山下,造林情形又是如何呢?在贫瘠恶劣的九九峰山腰,种上乌心石与榉木,除了这两种造林树种之外,其他自然长出的树种,有山黄麻与血桐等先趋树种。